Le Doyen de l’IGEN est nommé par arrêté par le Ministre, parmi les Inspecteurs généraux de l’Education Nationale. Il est responsable et coordonnateur du programme d’activité des Inspecteurs généraux. Le ministre peut désigner par arrêté, parmi les Inspecteurs généraux de l’Education, sur proposition du Doyen de l’IGEN, un adjoint au Doyen.

Les IGENS sont placés dans des groupes spécialisés (collèges). Les activités de chaque sont dirigées par des coordonnateurs nommés sur proposition de leurs pairs pour une durée de 3 ans renouvelable.

L’adjoint au Doyen de l’IGEN et les coordonnateurs des groupes spécialisés constituent le Conseil de l’Inspection Générale de l’Education Nationale qui est présidé par le Doyen de l’Inspection Générale ou par un Inspecteur général, le représentant et désigné par lui. Le Conseil délibère sur le programme du travail de l’IGEN ainsi que sur les rapports à publier Le Conseil donne son avis sur toutes les nominations aux postes de responsabilité concernant l’Inspection Générale.

L’IGEN intervient sur la base d’un programme annuel d’actions qu’elle soumet à l’approbation du Ministre de l’Education. Dans le cadre de l’exécution de ce programme, chaque Inspecteur général établit un rapport d’activités dans lequel il formule ses observations et suggestions portant sur le fonctionnement de son secteur d’activités et la qualité des prestations de ce dernier. Les différents rapports font l’objet d’une synthèse par le Coordonnateur des collèges et portée à la connaissance du Ministre de l’Education par le Doyen de l’IGEN. A la fin de chaque année scolaire, une rencontre solennelle de tous les Inspecteurs généraux, présidée par le Ministre de l’Education et les Ministres délégués, est consacrée à l’exposé des résultats des travaux de l’année écoulée et à la préparation du programme d’actions de l’année suivante.

Les Inspecteurs généraux animent les travaux des Commissions nationales de disciplines, chargées de l’élaboration de la réforme des enseignements Ils peuvent présider ces commissions.